Saatos sarjana Amérika Eric S. Lander sacara resmi ngusulkeun polimorfisme nukléotida tunggal (SNP) salaku pananda molekular generasi katilu dina 1996, SNP geus loba dipaké dina analisis asosiasi tret ékonomi, konstruksi peta beungkeut genetik biologis, jeung screening gén pathogenic manusa., Diagnosis jeung prediksi résiko panyakit, screening ubar individual, sarta widang panalungtikan biologis jeung médis séjén.Dina widang pembibitan pamotongan kontan, deteksi SNP tiasa ngawujudkeun seleksi awal tina sifat anu diperyogikeun.Pilihan ieu ngagaduhan ciri akurasi anu luhur sareng sacara efektif tiasa ngahindarkeun gangguan morfologi sareng faktor lingkungan, sahingga ngirangan pisan prosés beternak.Ku alatan éta, SNP muterkeun hiji peran badag dina widang panalungtikan dasar.

Polimorfisme Nukléotida Tunggal (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) nujul kana fénoména yén aya béda nukléotida tunggal dina posisi nu sarua dina runtuyan DNA individu-individu tina spésiés nu sarua atawa béda.Lebetkeun, ngahapus, konvérsi sareng inversi hiji dasar tiasa nyababkeun bédana ieu.Baheula, definisi SNP béda jeung mutasi.A lokus varian merlukeun yén frékuénsi salah sahiji alél dina populasi leuwih gede ti 1% dina urutan bisa dihartikeun salaku lokus SNP.Sanajan kitu, ku perluasan téori biologi modern jeung aplikasi tina téhnologi, frékuénsi alél geus euweuh hiji kaayaan diperlukeun pikeun ngawatesan harti SNP.Nurutkeun kana data variasi nukléotida tunggal nu kaasup kana database Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) handapeun National Center for Biotechnology Information (NCBI), insertion / hapusan frekuensi low, variasi microsatelit, jsb.

Dina awak manusa, frékuénsi SNP nyaéta 0,1%.Dina basa sejen, aya rata-rata hiji situs SNP per 1000 pasangan basa.Sanajan frékuénsi lumangsungna relatif luhur, teu sakabeh situs SNP bisa jadi spidol calon patali Tret.Ieu utamana patali jeung lokasi dimana SNP lumangsung.

Sacara téoritis, SNP tiasa lumangsung dimana waé dina sekuen génom.SNP anu lumangsung di wewengkon coding bisa ngahasilkeun mutasi sinonim jeung mutasi non-sinonim, nyaeta, asam amino robah atawa henteu robah saméméh jeung sanggeus mutasi.Asam amino nu robah biasana ngabalukarkeun ranté péptida leungit fungsi aslina (mutasi missense), sarta ogé bisa ngabalukarkeun tarjamahan abort (mutasi nonsense).SNP anu lumangsung di wewengkon non-coding jeung wewengkon intergenic bisa mangaruhan splicing mRNA, non-coding komposisi runtuyan RNA, sarta efisiensi mengikat faktor transkripsi jeung DNA.Hubungan husus ditémbongkeun dina gambar:

Jenis SNP:

Sababaraha metode ngetik SNP umum sareng ngabandingkeunana

Numutkeun prinsip anu béda, metode deteksi SNP umum dibagi kana kategori ieu:

Klasifikasi ngabandingkeun métode deteksi

Catetan: Didaptarkeun dina tabél ayeuna dipaké métode deteksi SNP leuwih umum, métode deteksi lianna kayaning hibridisasi situs husus (ASH), situs husus extension primer (ASPE), extension basa tunggal (SBCE), motong situs husus (ASC), téhnologi chip gén, téhnologi spéktrométri massa, jsb teu acan digolongkeun tur dibandingkeun.

Biaya sareng waktos purifikasi asam nukléat dina sababaraha metode deteksi SNP umum di luhur teu tiasa dihindari.Nanging, kit anu aya hubunganana dumasar kana téknologi PCR langsung Foregene tiasa langsung ngalaksanakeun PCR atanapi amplifikasi qPCR dina conto anu henteu dimurnikeun, anu nyababkeun genah anu teu pernah aya dina deteksi SNP.

Produk séri PCR langsung Foregene sacara sederhana sareng kasarna ngaleungitkeun léngkah-léngkah pemurnian sampel, anu ngirangan pisan waktos sareng biaya anu diperyogikeun pikeun nyiapkeun témplat.Polimérase Taq anu unik gaduh kamampuan amplifikasi anu saé sareng tiasa toleran rupa-rupa inhibitor tina lingkungan amplifikasi kompleks.ciri ieu nyadiakeun jaminan teknis pikeun meunangkeun-ngahasilkeun tinggi produk husus.Foregene Direct PCR / qPCR kit pikeun sagala rupa jenis sampel, kayaning: jaringan sato (buntut beurit, zebrafish, jsb), daun tutuwuhan, siki (kaasup polisakarida jeung sampel polifenol), jsb.